Une équipe du Barcelona Supercomputing Center – Centre national de supercalcul (BSC-CNS) a développé une technologie qui relie des agents d’intelligence artificielle (IA) à des outils spécialisés afin de créer des modèles numériques de tumeurs en quelques minutes, sans qu’il soit nécessaire d’être expert en programmation.
Cette avancée accélère le processus traditionnel, qui consiste à consulter des documentations longues, écrire du code et travailler avec différents programmes, ce qui peut nécessiter des mois, voire des années de travail. L’ensemble de ces étapes est désormais réduit à une simple conversation avec un agent d’IA doté de ces capacités, selon le BSC dans un communiqué.
L’étude, publiée dans la revue ‘npj Systems Biology and Applications’, décrit le développement d’outils spécialisés (serveurs MCP) conçus pour habiliter les agents d’IA existants à agir comme des intermédiaires entre les chercheurs et des outils de modélisation avancée tels que NeKo, MaBoSS et PhysiCell.
« Avec cette avancée, nous avons complètement levé les barrières qui séparaient les biologistes expérimentaux de l’utilisation d’outils avancés de modélisation (…). C’est très similaire à l’utilisation de ChatGPT; il n’est pas nécessaire d’écrire une seule ligne de code », a expliqué le chercheur du BSC Marco Ruscone, premier auteur de l’article.
Les créateurs des nouvelles outils ont souligné que tout chercheur disposant des connaissances suffisantes pourrait obtenir une première ébauche d’un jumeau numérique d’une tumeur avec lequel commencer à travailler en moins de 10 minutes.
REPRODUCIBILITÉ DES RÉSULTATS
Par ailleurs, l’article aborde des enjeux fondamentaux tels que la reproductibilité des résultats, l’un des piliers sur lesquels repose le système des publications scientifiques et qui semble difficile à atteindre lorsqu’on travaille avec des modèles de langage, en raison de leur nature probabiliste.
Cependant, les auteurs démontrent que, grâce à une interaction itérative et ciblée avec l’IA, il est possible d’obtenir des résultats cohérents et fiables, rapprochant la technologie des standards de la recherche scientifique.
« Différents modèles de langage peuvent vous donner des réponses différentes, tout comme cela arriverait si vous posiez la même question à différents scientifiques. La clé ici est de travailler avec eux en posant des questions encore et encore. Si vous les utilisez correctement, peu importent qu’ils disent des choses légèrement différentes, car à la fin ils convergent toujours vers le même noyau essentiel », a déclaré le chercheur du BSC Miguel Vázquez, troisième auteur de l’article.
Les serveurs MCP développés par le BSC sont déjà disponibles en accès libre pour la communauté scientifique. Le centre souligne que cette étude pose les bases de l’utilisation des agents intelligents pour accélérer la création de modèles biologiques et de jumeaux numériques qui facilitent l’étude de maladies comme le cancer.
