La ménopause modifie le microbiote vaginal et peut influencer le désir sexuel

17 octobre 2026



La baisse des œstrogènes pendant la ménopause peut provoquer des changements dans les tissus vaginaux et dans le microbiote, tandis que des facteurs tels que la douleur, les troubles du sommeil, la fatigue et l’humeur peuvent influencer le désir sexuel, selon Ana Sierra, psyconutritionniste et responsable du Service de Psychonutrition de la Clinique Neogenia, à l’occasion de la Journée mondiale de la ménopause, qui se célèbre le 18 octobre.

« Lorsqu’une femme consulte pour sécheresse, douleur ou désir diminué, nous devons aussi savoir comment elle dort, comment elle se sent émotionnellement et ce qui se passe avec sa santé digestive. Non pas parce que l’intestin explique tous les symptômes, mais parce que traiter une gêne de manière isolée peut laisser de côté des facteurs qui influent sur la manière dont elle les vit », explique Ana Sierra, psyconutritionniste et responsable du Service de Psychonutrition de la Clinique Neogenia.

Pendant la phase reproductive, chez de nombreuses femmes, prédominent différentes espèces de Lactobacillus dans le vagin. Ces bactéries contribuent à maintenir un pH acide. Avec la diminution des œstrogènes, l’épithélium vaginal peut devenir plus mince, perdre son élasticité et se lubrifier moins bien; le pH peut aussi augmenter et la présence de lactobacilles peut diminuer.

La sécheresse, les brûlures, les gênes urinaires et la douleur lors des rapports font partie du syndrome génito-urinaire de la ménopause. Cependant, la composition bactérienne n’explique pas à elle seule son intensité, de sorte que retrouver une plus grande présence de lactobacilles n’implique pas nécessairement que toutes les gênes disparaissent.

Certaines bactéries intestinales participent au métabolisme des œstrogènes. L’ensemble des gènes de la microbiote intestinal capables de produire des enzymes intervenant dans ce métabolisme s’appelle l’estrobolome. « L’estrobolome nous aide à comprendre que le métabolisme hormonal a aussi une relation avec l’intestin. Toutefois, nous ne pouvons promettre qu’un probiotique va restaurer la lubrification ou le désir », souligne Sierra.

Les changements de la transition ménopausique peuvent interagir avec la communication intestin-cerveau-hormones avec des processus liés à l’humeur et à la réponse au stress. Parler de la connexion cerveau-intestin-vagin permet de rassembler des mécanismes, mais cela ne signifie pas qu’il existe une chaîne causale unique démontrée pour tous les symptômes. Cela n’autorise pas non plus à attribuer une quelconque gêne vaginale ou émotionnelle à une altération intestinale.

Dans l’expérience quotidienne, ces liens incluent aussi la réponse à la douleur. Si les rapports deviennent douloureux à répétition, peut apparaître une crainte que cela se reproduise. Cette anticipation peut augmenter la tension du plancher pelvien et compliquer la réponse sexuelle, s’ajoutant aux changements physiques du tissu vaginal.

« Que le cerveau participe à la réponse à la douleur ne signifie pas que la gêne soit imaginaire. La douleur est réelle et peut amener la femme à anticiper une expérience désagréable. C’est pourquoi nous devons prendre en compte à la fois sa cause physique et ce qui la génère émotionnellement », explique l’experte.

POURQUOI LE DÉSIR PEUT DIMINUER À LA MÉNOPAUSE

Pendant cette étape, de nombreuses femmes expérimentent une diminution du désir sexuel, bien que cela ne se produise pas chez toutes ni avec la même intensité. Des changements hormonaux, la sécheresse et la douleur peuvent intervenir, ainsi que la fatigue, les troubles du sommeil, le stress ou l’humeur. La relation de couple et certains médicaments peuvent également influencer.

Avoir moins de lubrification n’équivaut pas nécessairement à ressentir moins de désir, mais les gênes persistantes peuvent finir par réduire l’intérêt pour les rapports. Cependant, on ne peut attribuer cette diminution à une altération précise de la microbiote. « Toutes les femmes ne consultent pas pour la même raison. Certaines ont du désir, mais ressentent de la douleur; d’autres sont épuisées, dorment mal ou ont perdu leur intérêt. Écouter cette différence est nécessaire pour décider quel accompagnement peut leur être utile », affirme Ana Sierra.

Pour l’éviter ou le réduire, le traitement peut inclure des hydratants vaginaux, des lubrifiants et, lorsque cela est indiqué, des options hormonales locales ou d’autres thérapies prescrites par un gynécologue. La physiothérapie du plancher pelvien peut aider en cas d’altération musculaire, tandis que l’accompagnement psychologique ou sexologique permet de travailler la peur de la douleur et son impact sur le désir ou le couple.

De plus, une alimentation et des habitudes de vie font partie des soins de la santé digestive et générale, mais ne remplacent pas le traitement des gênes vaginales; en ce qui concerne les probiotiques, les preuves restent limitées et ne permettent pas de les recommander comme solution générale pour la sécheresse, la douleur ou la diminution du désir.

« L’objectif est de comprendre ce qui se passe chez chaque femme et de coordonner les soins dont elle a besoin. La ménopause n’oblige pas à se résigner à la douleur, et une diminution du désir qui génère du mal-être mérite d’être écoutée et valorisée », conclut Sierra.

Thomas Leroy

Thomas Leroy

Je m’appelle Thomas Leroy et je suis le rédacteur de Placebo. Médecin de formation et passionné par le journalisme, j’ai choisi de créer ce média pour apporter une information claire et indépendante sur la santé et les addictions. Chaque jour, je m’engage à rendre accessibles des sujets complexes afin d’aider chacun à mieux comprendre et agir.