Un nouveau travail dirigé par l’Université de Pittsburgh (États‑Unis), publié dans Science Translational Medicine, montre que l’ensemble des participants d’un échantillon diversifié comprenant près de 100 000 personnes portait au moins une variante génétique qui influence la manière dont leur organisme métabolise les médicaments ; et chez environ un quart d’entre eux, on leur avait prescrit un médicament dont l’efficacité ou les effets peut être altéré par la variante qu’ils portaient.
Cette découverte met en évidence l’utilité de tests génétiques pour certains traitements et indique que des alertes dans le dossier de santé électronique pourraient être d’une grande aide lorsque le médecin prescrit l’un de ces médicaments. Une telle alerte permettrait au médecin d’envisager la prescription d’un médicament alternatif ou d’ajuster la posologie.
« De nombreuses personnes ont une expérience de traitements qui ne fonctionnent pas bien ou qui entraînent des effets secondaires, » explique l’auteur principal, Philip E. Empey, professeur associé à la Faculté de pharmacie de Pitt et directeur associé de pharmacogénomique à l’Institut de médecine de précision de Pitt et de l’UPMC. « Bien que de nombreux facteurs influent sur la réponse d’un patient à un médicament, nos résultats suggèrent que la génétique pourrait être un déterminant majeur pour une grande proportion de patients, ce qui souligne l’importance de la médecine de précision dans l’orientation des prescriptions. »
Plus de 300 médicaments comportent des informations sur les interactions avec des variantes génétiques sur leurs étiquettes, et les tests génétiques peuvent être utiles pour guider la prescription, précise Empey. Un exemple est un médicament de chimiothérapie utilisé pour le cancer du côlon qui pourrait provoquer une toxicité grave chez jusqu’à 8% des patients porteurs de ces variantes génétiques, raison pour laquelle ces patients subissent des tests préventifs avant le traitement.
L’équipe de recherche a utilisé des données du programme All of Us des National Institutes of Health (NIH), une initiative visant à rassembler les données d’un million de personnes à travers les États‑Unis afin de mieux comprendre comment le mode de vie, l’environnement et les gènes influent sur la santé et les maladies. L’Université de Pittsburgh est un partenaire clé du programme, ayant lancé All of Us Pennsylvania en 2018.
L’équipe a évalué la fréquence de 16 variantes génétiques connues pour influencer l’efficacité ou la toxicité de divers médicaments chez les participants. Il a été découvert que tous les participants portaient au moins une de ces variantes, avec une médiane de neuf variantes.
Après croisement des données génétiques avec les historiques médicaux des participants, l’équipe a découvert que 24,4% avaient reçu au moins un médicament qui interagit avec une variante génétique qu’ils portaient. Les médicaments les plus couramment identifiés dans l’étude étaient l’ondansétron (pour les nausées), l’ibuprofène (anti-inflammatoire), l’oméprazole et le pantoprazole (tous deux pour traiter le reflux gastrique et les brûlures d’estomac), et l’atorvastatine (pour réduire le cholestérol).
L’équipe a aussi identifié plus de 17 000 variantes nouvelles et a rapporté la fréquence des variantes génétiques connues liées à des médicaments dans plusieurs groupes d’ascendance, y compris dans des populations où ces fréquences n’étaient pas estimées auparavant.
« La faible diversité des groupes raciaux et ethniques dans les premiers travaux constitue un défi pour la recherche génétique et fausse les estimations de risque, » explique Empey. « C’est l’un des atouts du programme All of Us : il a été conçu pour aider à combler ces lacunes en incluant des personnes de divers âges, origines et expériences de vie. De plus, cela souligne l’intérêt d’un vaste ensemble de données de médecine de précision, où l’on peut étudier les données du séquençage génomique complet conjointement avec les données cliniques. »
Empey insiste sur le fait que ce sera aux législateurs et aux assureurs maladie d’évaluer les bénéfices du dépistage génétique généralisé des variantes qui interagissent avec les médicaments par rapport à leur coût, et que ce domaine demeure très dynamique. Il explique qu’il est logique de réaliser des tests chez les patients avec un panel génétique détectant les variantes communes qui influencent de nombreux médicaments et que ces résultats soient enregistrés dans leur dossier médical, au même titre qu’un test de fonction rénale. Cette approche est également appliquée lorsque les patients prennent plusieurs médicaments simultanément ou lorsqu’ils débutent certains traitements connus pour être influencés par la génétique, comme le clopidogrel, un médicament utilisé après la pose d’un stent cardiaque.
Selon Empey, les personnes qui ont déjà subi ce type d’analyse génétique, appelée pharmacogénomique, devraient partager leurs résultats avec leurs pharmaciens et leurs médecins prescripteurs afin qu’ils puissent être intégrés à leur dossier médical électronique. Empey dirige les efforts à l’UPMC pour aider les médecins à identifier les variantes génétiques susceptibles d’altérer un médicament prescrit et, si nécessaire, recommander des ajustements posologiques.
« Comme toute technologie nouvelle, tout se résume à une mise en œuvre responsable, » résume Empey. « Les coûts diminuent et les données augmentent, c’est pourquoi il est important que tant les patients que les médecins prennent conscience que l’utilisation de la médecine de précision dans la prescription devient une pratique courante. »
