Un étude menée auprès de plus de 700 personnes a démontré que celles ayant le Covid persistant présentent des différences distinctives dans le mélange de bactéries qui vivent dans leur bouche et leurs poumons, selon une étude menée par l’Université de Dundee, au Royaume-Uni.
La recherche, publiée dans le ‘European Respiratory Journal’, montre également que ces variations du microbiote pulmonaire se relient à des symptômes respiratoires ainsi qu’à des troubles cognitifs et digestifs connus dans le cadre du Covid persistant.
CHANGEMENTS DANS LA MICROBIOTE ORALE ET PULMONAIRE DANS LA COVID PERSISTANTE
Les chercheurs affirment que leurs résultats pourraient éclairer pourquoi certaines personnes développent une Covid persistante et pourraient indiquer de nouvelles approches pour traiter cette affection.
L’auteure principale de l’étude, Daniela Alferes de Lima Headley, de l’Université de Dundee, déclare: « Nous savons que des millions de personnes dans le monde restent touchées par la Covid persistante et que sa cause demeure inconnue. La Covid persistante affecte plusieurs organes. »
« Le microbiome est important pour maintenir la santé dans tout le corps, c’est pourquoi il constitue un candidat fort à contribuer à la Covid persistante. Des études antérieures ont montré certains changements dans le microbiome intestinal chez des cas de Covid persistant, mais la Covid est une maladie pulmonaire, il est donc logique d’examiner si le microbiome pulmonaire est altéré dans la Covid persistant ».
Cette recherche fait partie du PHOSP-COVID, financé conjointement par l’Institut national de la recherche en santé et en soins (NIHR) et UK Research and Innovation. L’étude a inclus 771 personnes ayant reçu un traitement pour la COVID-19 entre février 2020 et mars 2021 dans l’un des 38 hôpitaux du Royaume-Uni.
Les chercheurs ont réparti les participants en quatre groupes selon la gravité de leurs symptômes cinq mois après la sortie hospitalière. Ces groupes étaient: « très graves », avec de graves altérations physiques, mentales et cognitives; « graves », avec de graves problèmes mentaux et physiques, mais non cognitifs; « modérés », avec des difficultés principalement cognitives; et « légers », avec peu de symptômes et une bonne récupération.
Six mois après la sortie, les chercheurs ont prélevé des échantillons de salive des patients et d’expectorations pulmonaires, et ont utilisé le séquençage de l’ADN pour identifier les microbes présents. Ils ont analysé la diversité et la quantité de microbes et comparé ces données aux symptômes des patients.
Cela a démontré que les personnes atteintes de Covid persistant très grave présentaient des différences très marquées dans le microbiome de la bouche et des poumons, par rapport à celles qui ne souffraient pas de Covid persistant grave. On a également observé des différences liées à des symptômes spécifiques, tels que la réduction de la fonction pulmonaire (ce qui signifie que les poumons ne peuvent pas retenir autant d’air qu’en temps normal ou que l’air ne peut entrer et sortir de leurs voies avec la même facilité), des symptômes neurocognitifs (comme confusion mentale, difficultés de mémoire, d’attention et de concentration) et des symptômes gastro-intestinaux (douleurs, nausées, diarrrhée et perte d’appétit).
Parmi les changements associés aux symptômes persistants de la Covid-19, on a noté une surabondance de bactéries productrices d’acide lactique, ce qui a aussi été lié à des signes d’inflammation détectés dans des échantillons sanguins des patients.
L’étude était dirigée par le professeur James Chalmers, professeur d’Investigation Respiratoire à l’Université de Dundee, au Royaume-Uni, qui affirme: « Les personnes qui ont présenté les pires symptômes entre cinq et six mois après l’infection par le Covid-19 ont connu d’importants changements dans la microbiote buccale et pulmonaire. Nous avons également découvert que ces changements dans la microbiote des voies respiratoires n’étaient pas seulement liés à des problèmes pulmonaires, mais aussi à des symptômes tels que confusion mentale et troubles gastro-intestinaux, ce qui suggère que la microbiote pulmonaire pourrait avoir des répercussions sur la santé globale ».
LA MICROBIOTE PEUT-ELLE AIDER À DÉCOUVRIR DE NOUVEAUX TRAITEMENTS ?
Ce que nous ignorons, c’est si ces changements se sont produits avant l’infection par le COVID-19 ou s’ils sont apparus après. Nous ne savons pas non plus ce qui adviendra du microbiome des patients dans les années à venir. Nous aimerions savoir si ces changements s’améliorent avec le temps.
« Nous avons urgemment besoin de comprendre ce qui cause la Covid persistante, car elle demeure un problème sérieux de santé publique. Comprendre ses causes pourrait conduire à de meilleurs traitements; le microbiome peut être modifié par des antibiotiques, des probiotiques ou d’autres mesures. Nous espérons que nos découvertes stimuleront davantage de recherches sur la Covid persistant et, à l’avenir, nous aimerions voir des essais cliniques pour aider les personnes atteintes de cette maladie dévastatrice. »
Six ans après le début de la pandémie, nous ne comprenons pas encore pleinement pourquoi certaines personnes développent une Covid persistante ni quelle est la meilleure façon d’accompagner leur rétablissement. Cette vaste étude multicentrique identifie des motifs distinctifs dans le microbiote buccal et respiratoire des personnes présentant les symptômes les plus graves après leur hospitalisation pour Covid-19.
Il convient de souligner que ces motifs se sont associés non seulement à une détérioration respiratoire, mais aussi à des symptômes cognitifs et gastro-intestinaux. Ces résultats offrent une base importante pour de futures recherches longitudinales et mécanistiques. Si ces associations sont confirmées, elles pourraient nous aider à identifier de nouvelles façons de prédire, prévenir ou traiter les formes les plus invalidantes de Covid persistant.